KO first小鼠模型構建
一、KO-first 載體設計原理
KO-first載體通過精巧的基因陷阱(Gene Trap)和條件性模塊設計,實現"三位一體"功能:
野生型基因
KO-first等位基因
傳統KO
條件性KO
報告基因過表達
核心元件:
5'同源臂(1.5-3 kb)
SA-βgeo-pA(剪接受體-β半乳糖苷酶/新mei素抗性融合基因)
floxed 關鍵外顯子(通常第2-4號外顯子)
3'同源臂(1.5-3 kb)
FRT-flanked NeoR(用于陽性篩選,后續可切除)
二、KO first小鼠模型構建流程(以ES細胞同源重組為例)
1. 靶向載體構建
設計要點:
關鍵外顯子兩側插入loxP位點(間距通常1-2 kb)
在5'UTR插入SA-βgeo實現基因陷阱(組成型KO)
NeoR兩側加入FRT位點便于后續Flp刪除
改造
野生型基因: Exon1-Exon2-Exon3
KO-first等位基因: SA-βgeo-loxP-Exon2-loxP-FRT-NeoR-FRT
2. ES細胞打靶
電轉與篩選:
線性化載體電轉至JM8A3.N1等ES細胞
G418(NeoR)陽性篩選7-10天
克隆驗證:
5'端PCR:F1(同源臂外側) + R1(βgeo內)
3'端PCR:F2(NeoR內) + R2(同源臂外側)
Southern blot確認單拷貝整合
3. 獲得嵌合體小鼠
囊胚注射:將陽性ES細胞注入C57BL/6N囊胚
嵌合體鑒定:毛色嵌合(129Sv ES細胞→B6背景)
4. 傳代與品系建立
第一步交配:嵌合體(公鼠)× WT(母鼠)
獲得F1代(SA-βgeo-loxP-Exon2-loxP,NeoR+)
第二步交配:F1 × Flp deleter小鼠(刪除NeoR)
獲得"clean" KO-first小鼠(僅保留SA-βgeo和loxP)
三、三種應用模式切換
1. 傳統KO(組成型敲除)
機制:SA-βgeo阻斷基因轉錄,導致功能wan全喪失
驗證方法:
β-gal染色(報告基因表達)
Western blot檢測目標蛋白缺失
2. 條件性KO(組織特異性敲除)
交配策略:
× Cre
KO-first
cKO
關鍵點:
Cre介導的loxP重組刪除floxed外顯子
需驗證目標組織中的敲除效率(qPCR/免疫組化)
3. 報告基因過表達
利用SA-βgeo:
β-gal活性反映內源基因表達模式
可用于細胞譜系追蹤
4. 恢復野生型(可選)
與Flp deleter小鼠交配可刪除SA-βgeo,恢復野生型等位基因
四、技術優勢與局限性
優勢 | 挑戰 |
一個模型實現三種功能 | 載體構建復雜(需專業設計) |
避免多品系重復構建 | ES細胞打靶周期長(6-12個月) |
國際標準化(IKMC資源可獲取) | βgeo可能影響鄰近基因表達 |
五、關鍵優化策略
外顯子選擇:
優先選擇編碼關鍵功能域的外顯子
確保刪除后引起移碼突變(如外顯子2/3)
減少背景干擾:
使用自我刪除型NeoR(如neo-DTA)
選擇高重組效率ES細胞系(如JM8A3.N1)
表型分析對照:
必須包括:WT、KO-first純合子、KO-first × Cre
六、經典應用案例
Tsc1 KO-first模型:
傳統KO:胚胎致死(研究發育功能)
Nestin-Cre cKO:神經發育缺陷
β-gal報告基因:揭示Tsc1在腦區的表達模式
p53 KO-first模型:
傳統KO:自發腫瘤表型
K14-Cre cKO:研究皮膚特異性腫瘤發生